가장 흔한 증상입니다. 모든 베체트병 환자에서 관찰되며, 혀 주위 입안 점막이나 입안 깊은 곳인 후두 주위 등 입안 어느곳이나 발생합니다. 궤양의 크기는 대부분 1센티미터 이내이며 두세 개 정도가 가장 많고 드물게는 10개 이상도 관찰됩니다. 초기에는 작은 돌기로 시작하여 점차 커지면서 점막이 파이며, 궤양의 바닥에 하얗거나 약간 누런막이 형성되면서 몹시 아프게 됩니다. 1-2주가 지나면 없어졌다가 수 주일 후 또는 수개월 후에 재발합니다.

약 80%의 환자에서 관찰되면 구강궤양과 비슷한 궤양이 반복적으로 발생합니다. 남성에서는 음낭에 가장 많이 발생하고 음경에도 발생합니다. 여성에서는 외음에 가장 많이 발생하는데 통증을 수반하고 생리직전에 악화되는 경향이 있습니다. 드물게는 항문 주위에도 발생합니다.

50-80%에서 발생합니다. 여드름 모양의 피부염이 얼굴이나 상체에 발생하고, 5밀리미터 미만의 고름이 잡힌 병변이 관찰되기도 합니다. 홍반성 결절은 가장 많은 피부증상인데 주로 무릎 아래에 발생하고 1-2센티미터 크기의 붉은 색을 띄는 작은 덩어리가 피하에 발생하여 통증을 일으킵니다. 며칠 지나면 갈색으로 변하면서 부은 것도 가라않고 통증도 사라집니다. 이러한 증상들도 반복적으로 재발합니다.

환자의 약 50%에서 발생하며 일본에서는 성인의 시력상실의 가장 큰 원인이라 합니다. 눈의 통증, 눈부심, 눈물, 발적 및 시력장애가 반복적으로 발생합니다. 눈의 포도막의 앞쪽에 염증이 발생하면 전방포도막염이라 부르는데, 이때는 시력 장애는 거의 없으나 발적 및 통증이 심하고 후유증으로 백내장, 유착증이나 녹내장이 발생할 수 있습니다. 눈의 포도막의 뒤쪽에 염증이 발생하면 후방포도막염이라 부르는데 이때에는 망막출혈, 망막삼출과 망막혈관이 막혀 망막의 일부가 죽는 망막경색이 발생하여 시력장애가 오며 합병증으로 시신경 위축으로 시력상실이 발생할 수 있습니다.

한국이나 일본에선 약 30%의 환자가 증상을 나타내지만 중동지방에선 드물게 나타납니다. 복부의 오른쪽 아래 부분에 통증이 발생하는데 이것은 소장의 끝부분과 대장이 시작되는 부분에 입안에 발생하는 것과 같은 궤양이 발생하기 때문인데 심하면 출혈을 하여 대변이 검게 나오는 혈변이나, 장에 구멍이 뚤리는 천공이 발생하여 위험하게 되는 경우도 드물게 발생합니다.

환자의 약 25%에서 관찰되는데, 정맥염이 동맥염보다 더 자주 발생합니다. 정맥에 염증이 발생하면 정맥벽이 두꺼워지고 염증세포가 침입하게 되고 혈소판이 모이게 되어 혈액이 굳어지는 혈전이 발생하여 혈규가 막히게 됩니다. 장딴지에 잘 발생하여 장딴지가 붓고 통증이 발생합니다. 심한 경우엔 복부에 있는 굵은 대정맥이 막힐 수도 있습니다. 동맥염은 대동맥이나 폐동맥에 발생할 수 있습니다.